A kötelező oltás ellen érvelők általában az emberi alapjogokra hivatkoznak. Nyilvánvaló, hogy a modern demokráciák alapvető rendező elve, és egyben dilemmája, hogy hogyan lehet szabadnak maradni úgy, hogy ne sértsük mások szabadságát és a köz érdekeit. Dr. Kiszeli Noéminek, a Házi Jogorvos című lapban megjelent cikke szerint a következő alapjogokat kell számításba venni, amikor a kötelező védőoltásokról beszélünk:
1. élethez és emberi méltósághoz való jog
2. a gondolat, a lelkiismeret, a vallás szabadságához való jog